Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CLTAP09496 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTAP09496 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTAP09496 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTAP09496 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CLTAP09496 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTAP09496 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CLTAP09496 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTAP09496 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTAP09496 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CLTAP09496 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CLTAP09496 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTAP09496 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTAP09496 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
CLTAP09496 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTAP09496 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CLTAP09496 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTAP09496 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CLTAP09496 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTAP09496 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTAP09496 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTAP09496 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CLTAP09496 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTAP09496 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTAP09496 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CLTAP09496 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTAP09496 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTAP09496 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CLTAP09496 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CLTAP09496 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTAP09496 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTAP09496 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CLTAP09496 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTAP09496 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTAP09496 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTAP09496 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CLTAP09496 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTAP09496 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CLTAP09496 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTAP09496 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTAP09496 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CLTAP09496 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTAP09496 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTAP09496 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTAP09496 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CLTAP09496 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CLTAP09496 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTAP09496 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTAP09496 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CLTAP09496 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CLTAP09496 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CLTAP09496 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLTAP09496 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLTAP09496 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CLTAP09496 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTAP09496 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTAP09496 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTAP09496 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTAP09496 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTAP09496 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTAP09496 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CLTAP09496 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CLTAP09496 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CLTAP09496 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CLTAP09496 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTAP09496 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTAP09496 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTAP09496 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CLTAP09496 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLTAP09496 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLTAP09496 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CLTAP09496 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CLTAP09496 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CLTAP09496 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTAP09496 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTAP09496 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTAP09496 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTAP09496 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTAP09496 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTAP09496 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CLTAP09496 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLTAP09496 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CLTAP09496 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTAP09496 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTAP09496 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTAP09496 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTAP09496 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CLTAP09496 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CLTAP09496 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTAP09496 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTAP09496 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTAP09496 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CLTAP09496 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTAP09496 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTAP09496 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTAP09496 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTAP09496 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CLTAP09496 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLTAP09496 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CLTAP09496 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms