Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
MMP3P08254 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
MMP3P08254 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
MMP3P08254 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
MMP3P08254 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
MMP3P08254 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
MMP3P08254 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
MMP3P08254 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
MMP3P08254 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MMP3P08254 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
MMP3P08254 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
MMP3P08254 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
MMP3P08254 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
MMP3P08254 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MMP3P08254 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
MMP3P08254 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
MMP3P08254 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
MMP3P08254 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MMP3P08254 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
MMP3P08254 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
MMP3P08254 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
MMP3P08254 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
MMP3P08254 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MMP3P08254 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
MMP3P08254 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
MMP3P08254 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
MMP3P08254 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MMP3P08254 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MMP3P08254 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MMP3P08254 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
MMP3P08254 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
MMP3P08254 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
MMP3P08254 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MMP3P08254 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
MMP3P08254 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
MMP3P08254 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
MMP3P08254 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MMP3P08254 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
MMP3P08254 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MMP3P08254 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MMP3P08254 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
MMP3P08254 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
MMP3P08254 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MMP3P08254 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
MMP3P08254 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MMP3P08254 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MMP3P08254 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
MMP3P08254 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
MMP3P08254 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MMP3P08254 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
MMP3P08254 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
MMP3P08254 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
MMP3P08254 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
MMP3P08254 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MMP3P08254 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MMP3P08254 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MMP3P08254 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
MMP3P08254 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MMP3P08254 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
MMP3P08254 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
MMP3P08254 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
MMP3P08254 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
MMP3P08254 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
MMP3P08254 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MMP3P08254 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
MMP3P08254 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
MMP3P08254 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
MMP3P08254 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MMP3P08254 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MMP3P08254 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
MMP3P08254 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MMP3P08254 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MMP3P08254 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MMP3P08254 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
MMP3P08254 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
MMP3P08254 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MMP3P08254 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MMP3P08254 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
MMP3P08254 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
MMP3P08254 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.27■■■□□ 2.44
MMP3P08254 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
MMP3P08254 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MMP3P08254 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
MMP3P08254 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
MMP3P08254 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
MMP3P08254 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MMP3P08254 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
MMP3P08254 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
MMP3P08254 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
MMP3P08254 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MMP3P08254 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
MMP3P08254 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
MMP3P08254 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
MMP3P08254 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MMP3P08254 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
MMP3P08254 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MMP3P08254 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
MMP3P08254 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.16■■■□□ 2.42
MMP3P08254 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
MMP3P08254 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms