Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLBP06746 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
POLBP06746 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
POLBP06746 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
POLBP06746 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLBP06746 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
POLBP06746 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLBP06746 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
POLBP06746 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLBP06746 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
POLBP06746 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
POLBP06746 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
POLBP06746 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLBP06746 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
POLBP06746 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
POLBP06746 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLBP06746 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLBP06746 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
POLBP06746 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLBP06746 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLBP06746 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
POLBP06746 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
POLBP06746 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLBP06746 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
POLBP06746 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
POLBP06746 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
POLBP06746 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
POLBP06746 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLBP06746 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
POLBP06746 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
POLBP06746 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLBP06746 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
POLBP06746 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
POLBP06746 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLBP06746 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLBP06746 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLBP06746 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
POLBP06746 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
POLBP06746 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
POLBP06746 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
POLBP06746 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLBP06746 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLBP06746 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLBP06746 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
POLBP06746 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
POLBP06746 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLBP06746 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
POLBP06746 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLBP06746 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLBP06746 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLBP06746 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
POLBP06746 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
POLBP06746 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
POLBP06746 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
POLBP06746 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLBP06746 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLBP06746 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
POLBP06746 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
POLBP06746 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLBP06746 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLBP06746 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
POLBP06746 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLBP06746 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLBP06746 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
POLBP06746 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
POLBP06746 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLBP06746 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
POLBP06746 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
POLBP06746 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
POLBP06746 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
POLBP06746 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
POLBP06746 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLBP06746 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLBP06746 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLBP06746 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLBP06746 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
POLBP06746 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLBP06746 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
POLBP06746 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLBP06746 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
POLBP06746 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLBP06746 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLBP06746 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLBP06746 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
POLBP06746 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
POLBP06746 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
POLBP06746 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLBP06746 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
POLBP06746 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLBP06746 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
POLBP06746 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLBP06746 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
POLBP06746 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLBP06746 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLBP06746 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLBP06746 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLBP06746 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLBP06746 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
POLBP06746 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
POLBP06746 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms