Protein–RNA interactions for Protein: P06126

CD1A, T-cell surface glycoprotein CD1a, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1AP06126 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD1AP06126 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD1AP06126 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD1AP06126 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD1AP06126 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD1AP06126 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD1AP06126 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD1AP06126 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD1AP06126 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD1AP06126 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD1AP06126 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD1AP06126 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD1AP06126 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD1AP06126 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD1AP06126 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD1AP06126 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD1AP06126 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD1AP06126 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD1AP06126 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD1AP06126 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD1AP06126 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD1AP06126 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD1AP06126 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD1AP06126 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD1AP06126 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD1AP06126 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD1AP06126 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD1AP06126 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD1AP06126 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD1AP06126 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD1AP06126 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CD1AP06126 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD1AP06126 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD1AP06126 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD1AP06126 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD1AP06126 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD1AP06126 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD1AP06126 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD1AP06126 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD1AP06126 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CD1AP06126 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD1AP06126 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD1AP06126 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD1AP06126 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD1AP06126 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CD1AP06126 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD1AP06126 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD1AP06126 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD1AP06126 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD1AP06126 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD1AP06126 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD1AP06126 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD1AP06126 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD1AP06126 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD1AP06126 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD1AP06126 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD1AP06126 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD1AP06126 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD1AP06126 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD1AP06126 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD1AP06126 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD1AP06126 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CD1AP06126 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD1AP06126 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD1AP06126 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CD1AP06126 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD1AP06126 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD1AP06126 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD1AP06126 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD1AP06126 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD1AP06126 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD1AP06126 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD1AP06126 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD1AP06126 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD1AP06126 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD1AP06126 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD1AP06126 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CD1AP06126 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD1AP06126 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD1AP06126 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD1AP06126 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD1AP06126 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD1AP06126 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD1AP06126 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD1AP06126 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CD1AP06126 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD1AP06126 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD1AP06126 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD1AP06126 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD1AP06126 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD1AP06126 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD1AP06126 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD1AP06126 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD1AP06126 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD1AP06126 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD1AP06126 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD1AP06126 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD1AP06126 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CD1AP06126 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CD1AP06126 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms