Protein–RNA interactions for Protein: P05556

ITGB1, Integrin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1P05556 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGB1P05556 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ITGB1P05556 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ITGB1P05556 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ITGB1P05556 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ITGB1P05556 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB1P05556 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ITGB1P05556 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB1P05556 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB1P05556 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ITGB1P05556 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB1P05556 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ITGB1P05556 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ITGB1P05556 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ITGB1P05556 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ITGB1P05556 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGB1P05556 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ITGB1P05556 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB1P05556 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ITGB1P05556 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ITGB1P05556 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB1P05556 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB1P05556 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ITGB1P05556 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB1P05556 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ITGB1P05556 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGB1P05556 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGB1P05556 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGB1P05556 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
ITGB1P05556 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB1P05556 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ITGB1P05556 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB1P05556 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
ITGB1P05556 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB1P05556 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB1P05556 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB1P05556 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ITGB1P05556 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGB1P05556 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ITGB1P05556 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ITGB1P05556 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB1P05556 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ITGB1P05556 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ITGB1P05556 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGB1P05556 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGB1P05556 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ITGB1P05556 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB1P05556 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB1P05556 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB1P05556 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ITGB1P05556 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB1P05556 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ITGB1P05556 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB1P05556 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ITGB1P05556 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
ITGB1P05556 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB1P05556 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB1P05556 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
ITGB1P05556 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
ITGB1P05556 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
ITGB1P05556 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
ITGB1P05556 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGB1P05556 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGB1P05556 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGB1P05556 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGB1P05556 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGB1P05556 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGB1P05556 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGB1P05556 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGB1P05556 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGB1P05556 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGB1P05556 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB1P05556 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB1P05556 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB1P05556 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
ITGB1P05556 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
ITGB1P05556 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ITGB1P05556 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
ITGB1P05556 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB1P05556 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB1P05556 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
ITGB1P05556 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB1P05556 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB1P05556 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ITGB1P05556 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms