Protein–RNA interactions for Protein: P05129

PRKCG, Protein kinase C gamma type, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCGP05129 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRKCGP05129 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCGP05129 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRKCGP05129 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKCGP05129 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRKCGP05129 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRKCGP05129 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKCGP05129 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRKCGP05129 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PRKCGP05129 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PRKCGP05129 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PRKCGP05129 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKCGP05129 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PRKCGP05129 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PRKCGP05129 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCGP05129 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCGP05129 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCGP05129 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PRKCGP05129 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKCGP05129 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PRKCGP05129 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PRKCGP05129 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCGP05129 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCGP05129 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PRKCGP05129 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKCGP05129 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PRKCGP05129 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PRKCGP05129 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCGP05129 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCGP05129 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCGP05129 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCGP05129 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCGP05129 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PRKCGP05129 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PRKCGP05129 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PRKCGP05129 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCGP05129 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PRKCGP05129 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKCGP05129 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PRKCGP05129 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKCGP05129 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKCGP05129 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PRKCGP05129 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PRKCGP05129 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKCGP05129 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PRKCGP05129 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PRKCGP05129 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PRKCGP05129 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKCGP05129 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PRKCGP05129 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCGP05129 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCGP05129 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PRKCGP05129 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCGP05129 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCGP05129 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCGP05129 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PRKCGP05129 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCGP05129 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PRKCGP05129 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCGP05129 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PRKCGP05129 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PRKCGP05129 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PRKCGP05129 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PRKCGP05129 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCGP05129 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PRKCGP05129 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCGP05129 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PRKCGP05129 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCGP05129 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCGP05129 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PRKCGP05129 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCGP05129 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCGP05129 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PRKCGP05129 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PRKCGP05129 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PRKCGP05129 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCGP05129 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PRKCGP05129 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PRKCGP05129 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCGP05129 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCGP05129 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PRKCGP05129 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PRKCGP05129 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PRKCGP05129 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PRKCGP05129 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PRKCGP05129 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCGP05129 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCGP05129 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCGP05129 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCGP05129 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCGP05129 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRKCGP05129 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRKCGP05129 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRKCGP05129 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCGP05129 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRKCGP05129 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCGP05129 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRKCGP05129 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRKCGP05129 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRKCGP05129 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms