Protein–RNA interactions for Protein: P04792

HSPB1, Heat shock protein beta-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB1P04792 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HSPB1P04792 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HSPB1P04792 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB1P04792 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB1P04792 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HSPB1P04792 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB1P04792 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HSPB1P04792 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPB1P04792 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPB1P04792 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HSPB1P04792 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
HSPB1P04792 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
HSPB1P04792 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HSPB1P04792 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HSPB1P04792 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB1P04792 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB1P04792 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HSPB1P04792 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB1P04792 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB1P04792 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB1P04792 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HSPB1P04792 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB1P04792 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HSPB1P04792 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
HSPB1P04792 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
HSPB1P04792 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
HSPB1P04792 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HSPB1P04792 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB1P04792 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB1P04792 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HSPB1P04792 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HSPB1P04792 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB1P04792 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HSPB1P04792 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB1P04792 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HSPB1P04792 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HSPB1P04792 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB1P04792 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HSPB1P04792 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB1P04792 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HSPB1P04792 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HSPB1P04792 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSPB1P04792 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSPB1P04792 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
HSPB1P04792 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB1P04792 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB1P04792 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB1P04792 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
HSPB1P04792 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB1P04792 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
HSPB1P04792 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms