Protein–RNA interactions for Protein: P01780

IGHV3-7, Immunoglobulin heavy variable 3-7, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-7P01780 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
IGHV3-7P01780 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
IGHV3-7P01780 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
IGHV3-7P01780 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-7P01780 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
IGHV3-7P01780 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-7P01780 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-7P01780 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-7P01780 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-7P01780 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IGHV3-7P01780 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-7P01780 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-7P01780 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IGHV3-7P01780 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IGHV3-7P01780 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IGHV3-7P01780 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-7P01780 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-7P01780 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IGHV3-7P01780 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IGHV3-7P01780 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-7P01780 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-7P01780 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IGHV3-7P01780 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-7P01780 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-7P01780 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-7P01780 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IGHV3-7P01780 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IGHV3-7P01780 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IGHV3-7P01780 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-7P01780 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-7P01780 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IGHV3-7P01780 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-7P01780 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-7P01780 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IGHV3-7P01780 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IGHV3-7P01780 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-7P01780 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IGHV3-7P01780 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IGHV3-7P01780 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-7P01780 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IGHV3-7P01780 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGHV3-7P01780 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IGHV3-7P01780 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGHV3-7P01780 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGHV3-7P01780 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-7P01780 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-7P01780 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-7P01780 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGHV3-7P01780 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGHV3-7P01780 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-7P01780 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-7P01780 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-7P01780 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
IGHV3-7P01780 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGHV3-7P01780 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-7P01780 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGHV3-7P01780 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGHV3-7P01780 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms