Protein–RNA interactions for Protein: P01593

IGKV1D-33, Immunoglobulin kappa variable 1D-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-33P01593 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IGKV1D-33P01593 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IGKV1D-33P01593 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IGKV1D-33P01593 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1D-33P01593 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IGKV1D-33P01593 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1D-33P01593 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IGKV1D-33P01593 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-33P01593 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IGKV1D-33P01593 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV1D-33P01593 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IGKV1D-33P01593 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
IGKV1D-33P01593 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
IGKV1D-33P01593 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
IGKV1D-33P01593 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1D-33P01593 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
IGKV1D-33P01593 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV1D-33P01593 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
IGKV1D-33P01593 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
IGKV1D-33P01593 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV1D-33P01593 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV1D-33P01593 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
IGKV1D-33P01593 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV1D-33P01593 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV1D-33P01593 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
IGKV1D-33P01593 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGKV1D-33P01593 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
IGKV1D-33P01593 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGKV1D-33P01593 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGKV1D-33P01593 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms