Protein–RNA interactions for Protein: P01593

IGKV1D-33, Immunoglobulin kappa variable 1D-33, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-33P01593 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
IGKV1D-33P01593 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGKV1D-33P01593 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGKV1D-33P01593 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
IGKV1D-33P01593 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
IGKV1D-33P01593 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
IGKV1D-33P01593 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IGKV1D-33P01593 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGKV1D-33P01593 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
IGKV1D-33P01593 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
IGKV1D-33P01593 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGKV1D-33P01593 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
IGKV1D-33P01593 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
IGKV1D-33P01593 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
IGKV1D-33P01593 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
IGKV1D-33P01593 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
IGKV1D-33P01593 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGKV1D-33P01593 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IGKV1D-33P01593 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
IGKV1D-33P01593 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IGKV1D-33P01593 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGKV1D-33P01593 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
IGKV1D-33P01593 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGKV1D-33P01593 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGKV1D-33P01593 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGKV1D-33P01593 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGKV1D-33P01593 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
IGKV1D-33P01593 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
IGKV1D-33P01593 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGKV1D-33P01593 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
IGKV1D-33P01593 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGKV1D-33P01593 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
IGKV1D-33P01593 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
IGKV1D-33P01593 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
IGKV1D-33P01593 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IGKV1D-33P01593 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IGKV1D-33P01593 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IGKV1D-33P01593 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
IGKV1D-33P01593 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV1D-33P01593 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGKV1D-33P01593 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGKV1D-33P01593 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGKV1D-33P01593 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGKV1D-33P01593 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGKV1D-33P01593 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGKV1D-33P01593 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGKV1D-33P01593 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGKV1D-33P01593 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGKV1D-33P01593 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGKV1D-33P01593 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGKV1D-33P01593 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGKV1D-33P01593 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGKV1D-33P01593 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGKV1D-33P01593 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGKV1D-33P01593 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGKV1D-33P01593 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGKV1D-33P01593 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGKV1D-33P01593 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGKV1D-33P01593 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV1D-33P01593 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IGKV1D-33P01593 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGKV1D-33P01593 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGKV1D-33P01593 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
IGKV1D-33P01593 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV1D-33P01593 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGKV1D-33P01593 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGKV1D-33P01593 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IGKV1D-33P01593 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGKV1D-33P01593 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGKV1D-33P01593 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGKV1D-33P01593 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGKV1D-33P01593 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGKV1D-33P01593 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGKV1D-33P01593 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGKV1D-33P01593 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGKV1D-33P01593 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGKV1D-33P01593 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGKV1D-33P01593 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
IGKV1D-33P01593 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGKV1D-33P01593 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGKV1D-33P01593 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGKV1D-33P01593 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
IGKV1D-33P01593 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGKV1D-33P01593 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGKV1D-33P01593 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGKV1D-33P01593 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGKV1D-33P01593 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGKV1D-33P01593 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGKV1D-33P01593 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IGKV1D-33P01593 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGKV1D-33P01593 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGKV1D-33P01593 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGKV1D-33P01593 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGKV1D-33P01593 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGKV1D-33P01593 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IGKV1D-33P01593 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IGKV1D-33P01593 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV1D-33P01593 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IGKV1D-33P01593 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IGKV1D-33P01593 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms