Protein–RNA interactions for Protein: P01563

IFNA2, Interferon alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA2P01563 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNA2P01563 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IFNA2P01563 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IFNA2P01563 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNA2P01563 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IFNA2P01563 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNA2P01563 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IFNA2P01563 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNA2P01563 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IFNA2P01563 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IFNA2P01563 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNA2P01563 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IFNA2P01563 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IFNA2P01563 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNA2P01563 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
IFNA2P01563 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNA2P01563 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNA2P01563 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
IFNA2P01563 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNA2P01563 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNA2P01563 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNA2P01563 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
IFNA2P01563 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNA2P01563 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNA2P01563 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
IFNA2P01563 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNA2P01563 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNA2P01563 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNA2P01563 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
IFNA2P01563 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNA2P01563 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNA2P01563 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
IFNA2P01563 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNA2P01563 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNA2P01563 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
IFNA2P01563 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNA2P01563 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
IFNA2P01563 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNA2P01563 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
IFNA2P01563 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
IFNA2P01563 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
IFNA2P01563 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNA2P01563 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNA2P01563 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNA2P01563 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
IFNA2P01563 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNA2P01563 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23■■□□□ 1.27
IFNA2P01563 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
IFNA2P01563 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNA2P01563 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNA2P01563 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IFNA2P01563 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IFNA2P01563 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNA2P01563 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNA2P01563 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IFNA2P01563 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IFNA2P01563 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms