Protein–RNA interactions for Protein: P01036

CST4, Cystatin-S, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST4P01036 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST4P01036 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST4P01036 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CST4P01036 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST4P01036 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST4P01036 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST4P01036 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CST4P01036 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CST4P01036 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CST4P01036 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CST4P01036 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CST4P01036 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CST4P01036 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CST4P01036 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CST4P01036 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CST4P01036 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CST4P01036 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CST4P01036 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CST4P01036 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CST4P01036 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CST4P01036 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CST4P01036 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CST4P01036 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CST4P01036 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CST4P01036 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CST4P01036 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CST4P01036 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CST4P01036 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CST4P01036 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CST4P01036 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CST4P01036 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CST4P01036 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CST4P01036 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CST4P01036 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CST4P01036 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CST4P01036 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CST4P01036 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CST4P01036 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CST4P01036 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CST4P01036 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CST4P01036 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CST4P01036 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CST4P01036 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CST4P01036 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CST4P01036 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CST4P01036 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CST4P01036 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CST4P01036 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CST4P01036 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CST4P01036 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CST4P01036 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CST4P01036 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CST4P01036 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CST4P01036 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CST4P01036 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CST4P01036 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CST4P01036 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CST4P01036 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CST4P01036 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CST4P01036 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CST4P01036 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CST4P01036 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CST4P01036 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CST4P01036 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CST4P01036 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CST4P01036 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CST4P01036 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CST4P01036 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CST4P01036 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CST4P01036 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CST4P01036 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CST4P01036 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CST4P01036 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CST4P01036 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CST4P01036 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CST4P01036 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CST4P01036 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CST4P01036 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CST4P01036 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CST4P01036 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CST4P01036 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CST4P01036 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CST4P01036 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CST4P01036 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CST4P01036 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CST4P01036 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CST4P01036 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CST4P01036 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CST4P01036 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CST4P01036 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CST4P01036 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CST4P01036 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CST4P01036 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CST4P01036 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CST4P01036 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CST4P01036 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CST4P01036 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CST4P01036 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CST4P01036 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CST4P01036 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms