Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZBED1O96006 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZBED1O96006 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ZBED1O96006 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ZBED1O96006 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZBED1O96006 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ZBED1O96006 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ZBED1O96006 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED1O96006 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ZBED1O96006 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZBED1O96006 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZBED1O96006 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ZBED1O96006 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZBED1O96006 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZBED1O96006 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ZBED1O96006 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZBED1O96006 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ZBED1O96006 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ZBED1O96006 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ZBED1O96006 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZBED1O96006 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ZBED1O96006 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ZBED1O96006 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED1O96006 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ZBED1O96006 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ZBED1O96006 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ZBED1O96006 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ZBED1O96006 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED1O96006 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED1O96006 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ZBED1O96006 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ZBED1O96006 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ZBED1O96006 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED1O96006 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ZBED1O96006 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ZBED1O96006 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED1O96006 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ZBED1O96006 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ZBED1O96006 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED1O96006 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ZBED1O96006 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED1O96006 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED1O96006 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ZBED1O96006 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZBED1O96006 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED1O96006 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ZBED1O96006 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED1O96006 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ZBED1O96006 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ZBED1O96006 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED1O96006 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED1O96006 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED1O96006 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ZBED1O96006 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
ZBED1O96006 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ZBED1O96006 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
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