Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
MAP4K4O95819 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
MAP4K4O95819 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
MAP4K4O95819 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
MAP4K4O95819 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
MAP4K4O95819 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MAP4K4O95819 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
MAP4K4O95819 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MAP4K4O95819 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
MAP4K4O95819 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MAP4K4O95819 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MAP4K4O95819 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
MAP4K4O95819 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MAP4K4O95819 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MAP4K4O95819 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
MAP4K4O95819 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
MAP4K4O95819 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
MAP4K4O95819 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
MAP4K4O95819 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
MAP4K4O95819 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP4K4O95819 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP4K4O95819 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP4K4O95819 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
MAP4K4O95819 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MAP4K4O95819 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
MAP4K4O95819 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
MAP4K4O95819 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
MAP4K4O95819 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
MAP4K4O95819 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP4K4O95819 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP4K4O95819 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP4K4O95819 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP4K4O95819 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
MAP4K4O95819 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP4K4O95819 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
MAP4K4O95819 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
MAP4K4O95819 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
MAP4K4O95819 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MAP4K4O95819 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MAP4K4O95819 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MAP4K4O95819 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
MAP4K4O95819 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
MAP4K4O95819 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MAP4K4O95819 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MAP4K4O95819 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
MAP4K4O95819 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MAP4K4O95819 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
MAP4K4O95819 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP4K4O95819 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
MAP4K4O95819 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MAP4K4O95819 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP4K4O95819 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP4K4O95819 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP4K4O95819 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MAP4K4O95819 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP4K4O95819 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP4K4O95819 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MAP4K4O95819 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP4K4O95819 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MAP4K4O95819 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
MAP4K4O95819 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MAP4K4O95819 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33■■■□□ 2.87
MAP4K4O95819 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MAP4K4O95819 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
MAP4K4O95819 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
MAP4K4O95819 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MAP4K4O95819 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MAP4K4O95819 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MAP4K4O95819 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MAP4K4O95819 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
MAP4K4O95819 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MAP4K4O95819 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
MAP4K4O95819 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MAP4K4O95819 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
MAP4K4O95819 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP4K4O95819 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MAP4K4O95819 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP4K4O95819 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MAP4K4O95819 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MAP4K4O95819 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MAP4K4O95819 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP4K4O95819 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP4K4O95819 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP4K4O95819 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP4K4O95819 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
MAP4K4O95819 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MAP4K4O95819 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MAP4K4O95819 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MAP4K4O95819 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
MAP4K4O95819 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MAP4K4O95819 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MAP4K4O95819 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
MAP4K4O95819 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
MAP4K4O95819 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MAP4K4O95819 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MAP4K4O95819 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
MAP4K4O95819 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
MAP4K4O95819 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MAP4K4O95819 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
MAP4K4O95819 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms