Protein–RNA interactions for Protein: O95340

PAPSS2, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS2O95340 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPSS2O95340 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPSS2O95340 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PAPSS2O95340 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAPSS2O95340 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PAPSS2O95340 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
PAPSS2O95340 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PAPSS2O95340 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PAPSS2O95340 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAPSS2O95340 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PAPSS2O95340 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PAPSS2O95340 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAPSS2O95340 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PAPSS2O95340 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PAPSS2O95340 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PAPSS2O95340 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PAPSS2O95340 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAPSS2O95340 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PAPSS2O95340 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PAPSS2O95340 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PAPSS2O95340 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PAPSS2O95340 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PAPSS2O95340 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PAPSS2O95340 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PAPSS2O95340 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PAPSS2O95340 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPSS2O95340 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPSS2O95340 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPSS2O95340 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PAPSS2O95340 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PAPSS2O95340 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PAPSS2O95340 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPSS2O95340 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PAPSS2O95340 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PAPSS2O95340 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms