Protein–RNA interactions for Protein: O95264

HTR3B, 5-hydroxytryptamine receptor 3B, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR3BO95264 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR3BO95264 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR3BO95264 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR3BO95264 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR3BO95264 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR3BO95264 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR3BO95264 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HTR3BO95264 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HTR3BO95264 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR3BO95264 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR3BO95264 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HTR3BO95264 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR3BO95264 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR3BO95264 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HTR3BO95264 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR3BO95264 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HTR3BO95264 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HTR3BO95264 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR3BO95264 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR3BO95264 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HTR3BO95264 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HTR3BO95264 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HTR3BO95264 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR3BO95264 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR3BO95264 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HTR3BO95264 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR3BO95264 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HTR3BO95264 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR3BO95264 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HTR3BO95264 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HTR3BO95264 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HTR3BO95264 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HTR3BO95264 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HTR3BO95264 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR3BO95264 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR3BO95264 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR3BO95264 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
HTR3BO95264 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR3BO95264 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR3BO95264 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR3BO95264 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HTR3BO95264 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR3BO95264 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HTR3BO95264 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HTR3BO95264 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HTR3BO95264 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HTR3BO95264 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.2 ms