Protein–RNA interactions for Protein: O75865

TRAPPC6A, Trafficking protein particle complex subunit 6A, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC6AO75865 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRAPPC6AO75865 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC6AO75865 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRAPPC6AO75865 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRAPPC6AO75865 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRAPPC6AO75865 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRAPPC6AO75865 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRAPPC6AO75865 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC6AO75865 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC6AO75865 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRAPPC6AO75865 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC6AO75865 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRAPPC6AO75865 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRAPPC6AO75865 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC6AO75865 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRAPPC6AO75865 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC6AO75865 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRAPPC6AO75865 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRAPPC6AO75865 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRAPPC6AO75865 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRAPPC6AO75865 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC6AO75865 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRAPPC6AO75865 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC6AO75865 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRAPPC6AO75865 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC6AO75865 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC6AO75865 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC6AO75865 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC6AO75865 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC6AO75865 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRAPPC6AO75865 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRAPPC6AO75865 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRAPPC6AO75865 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRAPPC6AO75865 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC6AO75865 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC6AO75865 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRAPPC6AO75865 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRAPPC6AO75865 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC6AO75865 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC6AO75865 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC6AO75865 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRAPPC6AO75865 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC6AO75865 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRAPPC6AO75865 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC6AO75865 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC6AO75865 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRAPPC6AO75865 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRAPPC6AO75865 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRAPPC6AO75865 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRAPPC6AO75865 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRAPPC6AO75865 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC6AO75865 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC6AO75865 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC6AO75865 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRAPPC6AO75865 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC6AO75865 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC6AO75865 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRAPPC6AO75865 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC6AO75865 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRAPPC6AO75865 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRAPPC6AO75865 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRAPPC6AO75865 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms