Protein–RNA interactions for Protein: O75558

STX11, Syntaxin-11, humanhuman

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX11O75558 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX11O75558 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX11O75558 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STX11O75558 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STX11O75558 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STX11O75558 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX11O75558 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STX11O75558 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX11O75558 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX11O75558 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX11O75558 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STX11O75558 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STX11O75558 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STX11O75558 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
STX11O75558 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STX11O75558 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX11O75558 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX11O75558 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STX11O75558 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX11O75558 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX11O75558 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
STX11O75558 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STX11O75558 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX11O75558 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STX11O75558 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX11O75558 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX11O75558 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX11O75558 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX11O75558 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STX11O75558 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX11O75558 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STX11O75558 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
STX11O75558 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
STX11O75558 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
STX11O75558 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX11O75558 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
STX11O75558 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX11O75558 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
STX11O75558 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STX11O75558 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
STX11O75558 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
STX11O75558 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
STX11O75558 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX11O75558 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX11O75558 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
STX11O75558 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX11O75558 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
STX11O75558 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX11O75558 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
STX11O75558 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
STX11O75558 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
STX11O75558 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX11O75558 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX11O75558 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
STX11O75558 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX11O75558 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
STX11O75558 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
STX11O75558 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
STX11O75558 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
STX11O75558 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STX11O75558 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
STX11O75558 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX11O75558 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
STX11O75558 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX11O75558 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX11O75558 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
STX11O75558 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX11O75558 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX11O75558 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
STX11O75558 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
STX11O75558 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX11O75558 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
STX11O75558 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX11O75558 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
STX11O75558 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX11O75558 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
STX11O75558 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
STX11O75558 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
STX11O75558 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX11O75558 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX11O75558 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
STX11O75558 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
STX11O75558 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX11O75558 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX11O75558 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
STX11O75558 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
STX11O75558 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
STX11O75558 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
STX11O75558 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX11O75558 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX11O75558 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX11O75558 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
STX11O75558 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX11O75558 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
STX11O75558 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX11O75558 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX11O75558 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
STX11O75558 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
STX11O75558 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
STX11O75558 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms