Protein–RNA interactions for Protein: O75251

NDUFS7, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 7, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS7O75251 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFS7O75251 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
NDUFS7O75251 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NDUFS7O75251 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFS7O75251 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NDUFS7O75251 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFS7O75251 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NDUFS7O75251 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NDUFS7O75251 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFS7O75251 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFS7O75251 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFS7O75251 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFS7O75251 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFS7O75251 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFS7O75251 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDUFS7O75251 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFS7O75251 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFS7O75251 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFS7O75251 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFS7O75251 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFS7O75251 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFS7O75251 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFS7O75251 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFS7O75251 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFS7O75251 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NDUFS7O75251 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NDUFS7O75251 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
NDUFS7O75251 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NDUFS7O75251 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS7O75251 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NDUFS7O75251 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS7O75251 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS7O75251 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NDUFS7O75251 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NDUFS7O75251 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS7O75251 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS7O75251 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS7O75251 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NDUFS7O75251 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS7O75251 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS7O75251 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NDUFS7O75251 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms