Protein–RNA interactions for Protein: O60811

PRAMEF2, PRAME family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF2O60811 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PRAMEF2O60811 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF2O60811 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF2O60811 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF2O60811 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF2O60811 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF2O60811 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PRAMEF2O60811 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRAMEF2O60811 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF2O60811 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF2O60811 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF2O60811 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF2O60811 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF2O60811 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF2O60811 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF2O60811 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF2O60811 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF2O60811 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF2O60811 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRAMEF2O60811 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PRAMEF2O60811 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF2O60811 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF2O60811 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PRAMEF2O60811 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PRAMEF2O60811 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF2O60811 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF2O60811 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF2O60811 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PRAMEF2O60811 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF2O60811 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF2O60811 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF2O60811 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF2O60811 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF2O60811 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRAMEF2O60811 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF2O60811 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF2O60811 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF2O60811 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF2O60811 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF2O60811 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF2O60811 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF2O60811 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF2O60811 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRAMEF2O60811 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF2O60811 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF2O60811 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF2O60811 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF2O60811 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF2O60811 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRAMEF2O60811 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF2O60811 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF2O60811 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF2O60811 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms