Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD2O60548 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FOXD2O60548 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FOXD2O60548 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD2O60548 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD2O60548 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD2O60548 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD2O60548 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FOXD2O60548 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FOXD2O60548 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FOXD2O60548 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD2O60548 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD2O60548 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
FOXD2O60548 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FOXD2O60548 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FOXD2O60548 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD2O60548 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD2O60548 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FOXD2O60548 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
FOXD2O60548 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FOXD2O60548 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FOXD2O60548 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FOXD2O60548 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD2O60548 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD2O60548 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD2O60548 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FOXD2O60548 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FOXD2O60548 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD2O60548 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD2O60548 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FOXD2O60548 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FOXD2O60548 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD2O60548 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FOXD2O60548 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FOXD2O60548 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FOXD2O60548 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD2O60548 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD2O60548 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD2O60548 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FOXD2O60548 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FOXD2O60548 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD2O60548 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD2O60548 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD2O60548 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FOXD2O60548 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FOXD2O60548 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FOXD2O60548 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FOXD2O60548 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD2O60548 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD2O60548 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FOXD2O60548 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FOXD2O60548 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD2O60548 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD2O60548 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
FOXD2O60548 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD2O60548 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FOXD2O60548 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD2O60548 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD2O60548 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FOXD2O60548 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD2O60548 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
FOXD2O60548 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FOXD2O60548 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD2O60548 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FOXD2O60548 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
FOXD2O60548 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD2O60548 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD2O60548 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD2O60548 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FOXD2O60548 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD2O60548 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD2O60548 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD2O60548 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD2O60548 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD2O60548 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD2O60548 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD2O60548 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD2O60548 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FOXD2O60548 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FOXD2O60548 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms