Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
PLIN1O60240 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
PLIN1O60240 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
PLIN1O60240 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PLIN1O60240 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
PLIN1O60240 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
PLIN1O60240 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC35.2■■■■□ 3.22
PLIN1O60240 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC35.18■■■■□ 3.22
PLIN1O60240 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
PLIN1O60240 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
PLIN1O60240 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PLIN1O60240 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PLIN1O60240 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PLIN1O60240 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PLIN1O60240 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PLIN1O60240 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PLIN1O60240 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PLIN1O60240 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PLIN1O60240 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PLIN1O60240 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PLIN1O60240 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PLIN1O60240 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PLIN1O60240 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PLIN1O60240 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
PLIN1O60240 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PLIN1O60240 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PLIN1O60240 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PLIN1O60240 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PLIN1O60240 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PLIN1O60240 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PLIN1O60240 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PLIN1O60240 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PLIN1O60240 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PLIN1O60240 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PLIN1O60240 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PLIN1O60240 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PLIN1O60240 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
PLIN1O60240 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
PLIN1O60240 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PLIN1O60240 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PLIN1O60240 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PLIN1O60240 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PLIN1O60240 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
PLIN1O60240 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
PLIN1O60240 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PLIN1O60240 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
PLIN1O60240 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
PLIN1O60240 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
PLIN1O60240 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
PLIN1O60240 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
PLIN1O60240 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PLIN1O60240 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PLIN1O60240 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
PLIN1O60240 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PLIN1O60240 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
PLIN1O60240 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PLIN1O60240 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
PLIN1O60240 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
PLIN1O60240 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
PLIN1O60240 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PLIN1O60240 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PLIN1O60240 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
PLIN1O60240 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
PLIN1O60240 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PLIN1O60240 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
PLIN1O60240 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
PLIN1O60240 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
PLIN1O60240 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
PLIN1O60240 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
PLIN1O60240 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PLIN1O60240 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
PLIN1O60240 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
PLIN1O60240 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
PLIN1O60240 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
PLIN1O60240 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.72■■■■□ 3.15
PLIN1O60240 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
PLIN1O60240 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
PLIN1O60240 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
PLIN1O60240 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
PLIN1O60240 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
PLIN1O60240 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
PLIN1O60240 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms