Protein–RNA interactions for Protein: O43257

ZNHIT1, Zinc finger HIT domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT1O43257 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZNHIT1O43257 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNHIT1O43257 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNHIT1O43257 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNHIT1O43257 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNHIT1O43257 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNHIT1O43257 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNHIT1O43257 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNHIT1O43257 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNHIT1O43257 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNHIT1O43257 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNHIT1O43257 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNHIT1O43257 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNHIT1O43257 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNHIT1O43257 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNHIT1O43257 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNHIT1O43257 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNHIT1O43257 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNHIT1O43257 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNHIT1O43257 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNHIT1O43257 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNHIT1O43257 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNHIT1O43257 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNHIT1O43257 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNHIT1O43257 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ZNHIT1O43257 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNHIT1O43257 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNHIT1O43257 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNHIT1O43257 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNHIT1O43257 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNHIT1O43257 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNHIT1O43257 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT1O43257 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNHIT1O43257 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT1O43257 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT1O43257 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNHIT1O43257 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT1O43257 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNHIT1O43257 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNHIT1O43257 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT1O43257 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNHIT1O43257 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT1O43257 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNHIT1O43257 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNHIT1O43257 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT1O43257 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT1O43257 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNHIT1O43257 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT1O43257 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNHIT1O43257 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms