Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDUFS4O43181 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDUFS4O43181 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDUFS4O43181 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDUFS4O43181 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDUFS4O43181 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDUFS4O43181 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDUFS4O43181 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDUFS4O43181 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NDUFS4O43181 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDUFS4O43181 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDUFS4O43181 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDUFS4O43181 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDUFS4O43181 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDUFS4O43181 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NDUFS4O43181 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
NDUFS4O43181 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDUFS4O43181 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDUFS4O43181 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NDUFS4O43181 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDUFS4O43181 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
NDUFS4O43181 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NDUFS4O43181 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
NDUFS4O43181 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
NDUFS4O43181 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NDUFS4O43181 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDUFS4O43181 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDUFS4O43181 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NDUFS4O43181 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NDUFS4O43181 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDUFS4O43181 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NDUFS4O43181 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NDUFS4O43181 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NDUFS4O43181 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NDUFS4O43181 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NDUFS4O43181 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDUFS4O43181 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NDUFS4O43181 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDUFS4O43181 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NDUFS4O43181 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NDUFS4O43181 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDUFS4O43181 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NDUFS4O43181 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFS4O43181 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NDUFS4O43181 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NDUFS4O43181 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NDUFS4O43181 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NDUFS4O43181 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NDUFS4O43181 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFS4O43181 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NDUFS4O43181 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NDUFS4O43181 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms