Protein–RNA interactions for Protein: O15254

ACOX3, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 3, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOX3O15254 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACOX3O15254 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ACOX3O15254 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ACOX3O15254 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACOX3O15254 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ACOX3O15254 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACOX3O15254 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACOX3O15254 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACOX3O15254 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ACOX3O15254 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACOX3O15254 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ACOX3O15254 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
ACOX3O15254 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACOX3O15254 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ACOX3O15254 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACOX3O15254 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACOX3O15254 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ACOX3O15254 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ACOX3O15254 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACOX3O15254 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACOX3O15254 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ACOX3O15254 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ACOX3O15254 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ACOX3O15254 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACOX3O15254 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACOX3O15254 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ACOX3O15254 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACOX3O15254 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACOX3O15254 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ACOX3O15254 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACOX3O15254 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACOX3O15254 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ACOX3O15254 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACOX3O15254 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACOX3O15254 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACOX3O15254 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ACOX3O15254 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
ACOX3O15254 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ACOX3O15254 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ACOX3O15254 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ACOX3O15254 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ACOX3O15254 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ACOX3O15254 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACOX3O15254 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACOX3O15254 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ACOX3O15254 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ACOX3O15254 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ACOX3O15254 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACOX3O15254 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACOX3O15254 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACOX3O15254 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ACOX3O15254 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ACOX3O15254 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ACOX3O15254 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ACOX3O15254 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACOX3O15254 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ACOX3O15254 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ACOX3O15254 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ACOX3O15254 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ACOX3O15254 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACOX3O15254 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ACOX3O15254 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ACOX3O15254 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACOX3O15254 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACOX3O15254 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ACOX3O15254 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACOX3O15254 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ACOX3O15254 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACOX3O15254 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ACOX3O15254 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACOX3O15254 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ACOX3O15254 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACOX3O15254 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACOX3O15254 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ACOX3O15254 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACOX3O15254 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ACOX3O15254 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACOX3O15254 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ACOX3O15254 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACOX3O15254 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACOX3O15254 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACOX3O15254 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACOX3O15254 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACOX3O15254 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACOX3O15254 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACOX3O15254 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACOX3O15254 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACOX3O15254 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACOX3O15254 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ACOX3O15254 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACOX3O15254 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACOX3O15254 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACOX3O15254 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACOX3O15254 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACOX3O15254 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACOX3O15254 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACOX3O15254 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACOX3O15254 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACOX3O15254 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACOX3O15254 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms