Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
POLR1CO15160 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1CO15160 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
POLR1CO15160 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
POLR1CO15160 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1CO15160 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1CO15160 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1CO15160 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1CO15160 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1CO15160 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
POLR1CO15160 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
POLR1CO15160 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1CO15160 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1CO15160 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1CO15160 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
POLR1CO15160 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1CO15160 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1CO15160 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1CO15160 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
POLR1CO15160 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
POLR1CO15160 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
POLR1CO15160 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1CO15160 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1CO15160 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
POLR1CO15160 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1CO15160 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
POLR1CO15160 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26■■□□□ 1.75
POLR1CO15160 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1CO15160 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
POLR1CO15160 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
POLR1CO15160 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1CO15160 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
POLR1CO15160 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1CO15160 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1CO15160 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
POLR1CO15160 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
POLR1CO15160 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1CO15160 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
POLR1CO15160 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
POLR1CO15160 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1CO15160 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
POLR1CO15160 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1CO15160 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
POLR1CO15160 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
POLR1CO15160 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1CO15160 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1CO15160 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
POLR1CO15160 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
POLR1CO15160 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
POLR1CO15160 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1CO15160 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1CO15160 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1CO15160 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
POLR1CO15160 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1CO15160 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
POLR1CO15160 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
POLR1CO15160 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1CO15160 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1CO15160 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1CO15160 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1CO15160 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1CO15160 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
POLR1CO15160 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
POLR1CO15160 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1CO15160 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms