Protein–RNA interactions for Protein: O14649

KCNK3, Potassium channel subfamily K member 3, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK3O14649 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNK3O14649 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KCNK3O14649 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNK3O14649 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNK3O14649 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KCNK3O14649 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KCNK3O14649 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNK3O14649 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNK3O14649 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KCNK3O14649 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KCNK3O14649 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNK3O14649 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNK3O14649 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KCNK3O14649 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KCNK3O14649 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KCNK3O14649 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNK3O14649 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNK3O14649 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNK3O14649 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KCNK3O14649 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
KCNK3O14649 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KCNK3O14649 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNK3O14649 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KCNK3O14649 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNK3O14649 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KCNK3O14649 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KCNK3O14649 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KCNK3O14649 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNK3O14649 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KCNK3O14649 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNK3O14649 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KCNK3O14649 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNK3O14649 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KCNK3O14649 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNK3O14649 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNK3O14649 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KCNK3O14649 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNK3O14649 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KCNK3O14649 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNK3O14649 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KCNK3O14649 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNK3O14649 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNK3O14649 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KCNK3O14649 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KCNK3O14649 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
KCNK3O14649 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
KCNK3O14649 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNK3O14649 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNK3O14649 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNK3O14649 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNK3O14649 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KCNK3O14649 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNK3O14649 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KCNK3O14649 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNK3O14649 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KCNK3O14649 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KCNK3O14649 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNK3O14649 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNK3O14649 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KCNK3O14649 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNK3O14649 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KCNK3O14649 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KCNK3O14649 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KCNK3O14649 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNK3O14649 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNK3O14649 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KCNK3O14649 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNK3O14649 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNK3O14649 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KCNK3O14649 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNK3O14649 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KCNK3O14649 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNK3O14649 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNK3O14649 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KCNK3O14649 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNK3O14649 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNK3O14649 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNK3O14649 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNK3O14649 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNK3O14649 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KCNK3O14649 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KCNK3O14649 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms