Protein–RNA interactions for Protein: O14523

C2CD2L, Phospholipid transfer protein C2CD2L, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2CD2LO14523 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
C2CD2LO14523 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
C2CD2LO14523 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
C2CD2LO14523 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C2CD2LO14523 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C2CD2LO14523 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
C2CD2LO14523 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C2CD2LO14523 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
C2CD2LO14523 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
C2CD2LO14523 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
C2CD2LO14523 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
C2CD2LO14523 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
C2CD2LO14523 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
C2CD2LO14523 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C2CD2LO14523 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C2CD2LO14523 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C2CD2LO14523 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C2CD2LO14523 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
C2CD2LO14523 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C2CD2LO14523 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C2CD2LO14523 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
C2CD2LO14523 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C2CD2LO14523 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C2CD2LO14523 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
C2CD2LO14523 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
C2CD2LO14523 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C2CD2LO14523 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
C2CD2LO14523 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C2CD2LO14523 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C2CD2LO14523 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
C2CD2LO14523 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C2CD2LO14523 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C2CD2LO14523 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C2CD2LO14523 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
C2CD2LO14523 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
C2CD2LO14523 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C2CD2LO14523 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
C2CD2LO14523 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C2CD2LO14523 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C2CD2LO14523 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C2CD2LO14523 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
C2CD2LO14523 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
C2CD2LO14523 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
C2CD2LO14523 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
C2CD2LO14523 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
C2CD2LO14523 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
C2CD2LO14523 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C2CD2LO14523 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
C2CD2LO14523 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C2CD2LO14523 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
C2CD2LO14523 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms