Protein–RNA interactions for Protein: O14497

ARID1A, AT-rich interactive domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 2,285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID1AO14497 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID1AO14497 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARID1AO14497 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID1AO14497 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID1AO14497 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARID1AO14497 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ARID1AO14497 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ARID1AO14497 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ARID1AO14497 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ARID1AO14497 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID1AO14497 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ARID1AO14497 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID1AO14497 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ARID1AO14497 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID1AO14497 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID1AO14497 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ARID1AO14497 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID1AO14497 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ARID1AO14497 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID1AO14497 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID1AO14497 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID1AO14497 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ARID1AO14497 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ARID1AO14497 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID1AO14497 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID1AO14497 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ARID1AO14497 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID1AO14497 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID1AO14497 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ARID1AO14497 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID1AO14497 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID1AO14497 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID1AO14497 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID1AO14497 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ARID1AO14497 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ARID1AO14497 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID1AO14497 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ARID1AO14497 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID1AO14497 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ARID1AO14497 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ARID1AO14497 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID1AO14497 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID1AO14497 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ARID1AO14497 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID1AO14497 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID1AO14497 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID1AO14497 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID1AO14497 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ARID1AO14497 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ARID1AO14497 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID1AO14497 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ARID1AO14497 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID1AO14497 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ARID1AO14497 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID1AO14497 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID1AO14497 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID1AO14497 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID1AO14497 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ARID1AO14497 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID1AO14497 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID1AO14497 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID1AO14497 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ARID1AO14497 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARID1AO14497 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARID1AO14497 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARID1AO14497 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARID1AO14497 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARID1AO14497 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms