Protein–RNA interactions for Protein: H7C0C1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C0C1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C0C1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C0C1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H7C0C1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
H7C0C1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H7C0C1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H7C0C1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H7C0C1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
H7C0C1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
H7C0C1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C0C1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C0C1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H7C0C1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C0C1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C0C1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C0C1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C0C1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C0C1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C0C1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C0C1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C0C1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C0C1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C0C1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C0C1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
H7C0C1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
H7C0C1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
H7C0C1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
H7C0C1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
H7C0C1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
H7C0C1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
H7C0C1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C0C1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
H7C0C1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
H7C0C1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
H7C0C1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
H7C0C1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C0C1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C0C1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
H7C0C1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H7C0C1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
H7C0C1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H7C0C1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
H7C0C1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
H7C0C1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
H7C0C1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
H7C0C1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H7C0C1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
H7C0C1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
H7C0C1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
H7C0C1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
H7C0C1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
H7C0C1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C0C1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C0C1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
H7C0C1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C0C1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
H7C0C1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
H7C0C1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
H7C0C1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
H7C0C1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
H7C0C1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
H7C0C1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
H7C0C1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C0C1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C0C1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
H7C0C1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C0C1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C0C1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C0C1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
H7C0C1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
H7C0C1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H7C0C1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H7C0C1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
H7C0C1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H7C0C1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.55■■■□□ 2
H7C0C1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
H7C0C1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
H7C0C1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H7C0C1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H7C0C1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
H7C0C1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
H7C0C1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
H7C0C1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
H7C0C1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
H7C0C1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C0C1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C0C1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
H7C0C1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C0C1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C0C1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C0C1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
H7C0C1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
H7C0C1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
H7C0C1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H7C0C1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
H7C0C1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
H7C0C1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
H7C0C1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
H7C0C1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
H7C0C1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71 ms