Protein–RNA interactions for Protein: H3BP13

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LH3BP13 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRAPPC2LH3BP13 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC2LH3BP13 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRAPPC2LH3BP13 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC2LH3BP13 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC2LH3BP13 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRAPPC2LH3BP13 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC2LH3BP13 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC2LH3BP13 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRAPPC2LH3BP13 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRAPPC2LH3BP13 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRAPPC2LH3BP13 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRAPPC2LH3BP13 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRAPPC2LH3BP13 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC2LH3BP13 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRAPPC2LH3BP13 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC2LH3BP13 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC2LH3BP13 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRAPPC2LH3BP13 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC2LH3BP13 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC2LH3BP13 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRAPPC2LH3BP13 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC2LH3BP13 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRAPPC2LH3BP13 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRAPPC2LH3BP13 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC2LH3BP13 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRAPPC2LH3BP13 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2LH3BP13 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2LH3BP13 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2LH3BP13 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2LH3BP13 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2LH3BP13 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRAPPC2LH3BP13 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC2LH3BP13 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRAPPC2LH3BP13 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRAPPC2LH3BP13 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRAPPC2LH3BP13 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRAPPC2LH3BP13 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC2LH3BP13 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRAPPC2LH3BP13 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC2LH3BP13 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TRAPPC2LH3BP13 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRAPPC2LH3BP13 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC2LH3BP13 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRAPPC2LH3BP13 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC2LH3BP13 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC2LH3BP13 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRAPPC2LH3BP13 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC2LH3BP13 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC2LH3BP13 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRAPPC2LH3BP13 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC2LH3BP13 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC2LH3BP13 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRAPPC2LH3BP13 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC2LH3BP13 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRAPPC2LH3BP13 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRAPPC2LH3BP13 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC2LH3BP13 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRAPPC2LH3BP13 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC2LH3BP13 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC2LH3BP13 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRAPPC2LH3BP13 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC2LH3BP13 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC2LH3BP13 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRAPPC2LH3BP13 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRAPPC2LH3BP13 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRAPPC2LH3BP13 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC2LH3BP13 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRAPPC2LH3BP13 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRAPPC2LH3BP13 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC2LH3BP13 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRAPPC2LH3BP13 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC2LH3BP13 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC2LH3BP13 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TRAPPC2LH3BP13 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC2LH3BP13 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC2LH3BP13 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRAPPC2LH3BP13 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAPPC2LH3BP13 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.8 ms