Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MCRIP1C9JLW8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCRIP1C9JLW8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCRIP1C9JLW8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCRIP1C9JLW8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCRIP1C9JLW8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCRIP1C9JLW8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCRIP1C9JLW8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCRIP1C9JLW8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MCRIP1C9JLW8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCRIP1C9JLW8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCRIP1C9JLW8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCRIP1C9JLW8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCRIP1C9JLW8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCRIP1C9JLW8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCRIP1C9JLW8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCRIP1C9JLW8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCRIP1C9JLW8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCRIP1C9JLW8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCRIP1C9JLW8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCRIP1C9JLW8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCRIP1C9JLW8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCRIP1C9JLW8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCRIP1C9JLW8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCRIP1C9JLW8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCRIP1C9JLW8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MCRIP1C9JLW8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCRIP1C9JLW8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MCRIP1C9JLW8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
MCRIP1C9JLW8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MCRIP1C9JLW8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCRIP1C9JLW8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
MCRIP1C9JLW8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCRIP1C9JLW8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MCRIP1C9JLW8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCRIP1C9JLW8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MCRIP1C9JLW8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCRIP1C9JLW8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCRIP1C9JLW8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
MCRIP1C9JLW8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
MCRIP1C9JLW8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCRIP1C9JLW8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
MCRIP1C9JLW8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCRIP1C9JLW8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
MCRIP1C9JLW8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
MCRIP1C9JLW8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
MCRIP1C9JLW8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCRIP1C9JLW8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
MCRIP1C9JLW8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCRIP1C9JLW8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCRIP1C9JLW8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MCRIP1C9JLW8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCRIP1C9JLW8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCRIP1C9JLW8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MCRIP1C9JLW8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCRIP1C9JLW8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCRIP1C9JLW8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCRIP1C9JLW8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MCRIP1C9JLW8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MCRIP1C9JLW8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCRIP1C9JLW8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MCRIP1C9JLW8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCRIP1C9JLW8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCRIP1C9JLW8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MCRIP1C9JLW8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MCRIP1C9JLW8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCRIP1C9JLW8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCRIP1C9JLW8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCRIP1C9JLW8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCRIP1C9JLW8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MCRIP1C9JLW8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MCRIP1C9JLW8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MCRIP1C9JLW8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCRIP1C9JLW8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCRIP1C9JLW8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCRIP1C9JLW8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCRIP1C9JLW8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCRIP1C9JLW8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCRIP1C9JLW8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCRIP1C9JLW8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCRIP1C9JLW8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCRIP1C9JLW8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms