Protein–RNA interactions for Protein: B2RXH2

KDM4E, Lysine-specific demethylase 4E, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4EB2RXH2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4EB2RXH2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM4EB2RXH2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM4EB2RXH2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM4EB2RXH2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM4EB2RXH2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4EB2RXH2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4EB2RXH2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM4EB2RXH2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM4EB2RXH2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4EB2RXH2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4EB2RXH2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4EB2RXH2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM4EB2RXH2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4EB2RXH2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM4EB2RXH2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4EB2RXH2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KDM4EB2RXH2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4EB2RXH2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KDM4EB2RXH2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4EB2RXH2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4EB2RXH2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KDM4EB2RXH2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4EB2RXH2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4EB2RXH2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
KDM4EB2RXH2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4EB2RXH2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4EB2RXH2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4EB2RXH2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KDM4EB2RXH2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM4EB2RXH2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM4EB2RXH2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KDM4EB2RXH2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KDM4EB2RXH2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KDM4EB2RXH2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4EB2RXH2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4EB2RXH2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KDM4EB2RXH2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4EB2RXH2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4EB2RXH2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4EB2RXH2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM4EB2RXH2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM4EB2RXH2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM4EB2RXH2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM4EB2RXH2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM4EB2RXH2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM4EB2RXH2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KDM4EB2RXH2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4EB2RXH2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4EB2RXH2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KDM4EB2RXH2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4EB2RXH2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KDM4EB2RXH2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KDM4EB2RXH2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KDM4EB2RXH2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4EB2RXH2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4EB2RXH2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4EB2RXH2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KDM4EB2RXH2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM4EB2RXH2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KDM4EB2RXH2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4EB2RXH2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KDM4EB2RXH2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KDM4EB2RXH2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4EB2RXH2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KDM4EB2RXH2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KDM4EB2RXH2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4EB2RXH2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4EB2RXH2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KDM4EB2RXH2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KDM4EB2RXH2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KDM4EB2RXH2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms