Protein–RNA interactions for Protein: B2RXF0

TMEM229A, Transmembrane protein 229A, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229AB2RXF0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM229AB2RXF0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM229AB2RXF0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM229AB2RXF0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM229AB2RXF0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM229AB2RXF0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM229AB2RXF0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM229AB2RXF0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM229AB2RXF0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM229AB2RXF0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMEM229AB2RXF0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM229AB2RXF0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMEM229AB2RXF0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM229AB2RXF0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM229AB2RXF0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMEM229AB2RXF0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM229AB2RXF0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM229AB2RXF0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM229AB2RXF0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMEM229AB2RXF0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMEM229AB2RXF0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMEM229AB2RXF0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM229AB2RXF0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMEM229AB2RXF0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM229AB2RXF0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM229AB2RXF0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM229AB2RXF0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMEM229AB2RXF0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM229AB2RXF0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM229AB2RXF0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM229AB2RXF0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM229AB2RXF0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMEM229AB2RXF0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMEM229AB2RXF0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM229AB2RXF0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM229AB2RXF0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM229AB2RXF0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM229AB2RXF0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM229AB2RXF0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM229AB2RXF0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM229AB2RXF0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM229AB2RXF0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM229AB2RXF0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM229AB2RXF0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM229AB2RXF0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM229AB2RXF0 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM229AB2RXF0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM229AB2RXF0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM229AB2RXF0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM229AB2RXF0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM229AB2RXF0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM229AB2RXF0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM229AB2RXF0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM229AB2RXF0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM229AB2RXF0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM229AB2RXF0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
TMEM229AB2RXF0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM229AB2RXF0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM229AB2RXF0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM229AB2RXF0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM229AB2RXF0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM229AB2RXF0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM229AB2RXF0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM229AB2RXF0 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM229AB2RXF0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM229AB2RXF0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM229AB2RXF0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM229AB2RXF0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms