Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
GABRR3A8MPY1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GABRR3A8MPY1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
GABRR3A8MPY1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GABRR3A8MPY1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRR3A8MPY1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRR3A8MPY1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
GABRR3A8MPY1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRR3A8MPY1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GABRR3A8MPY1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GABRR3A8MPY1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRR3A8MPY1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRR3A8MPY1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GABRR3A8MPY1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRR3A8MPY1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GABRR3A8MPY1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRR3A8MPY1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GABRR3A8MPY1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRR3A8MPY1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRR3A8MPY1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GABRR3A8MPY1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GABRR3A8MPY1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
GABRR3A8MPY1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABRR3A8MPY1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GABRR3A8MPY1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GABRR3A8MPY1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRR3A8MPY1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GABRR3A8MPY1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GABRR3A8MPY1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRR3A8MPY1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GABRR3A8MPY1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GABRR3A8MPY1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRR3A8MPY1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRR3A8MPY1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GABRR3A8MPY1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRR3A8MPY1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GABRR3A8MPY1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GABRR3A8MPY1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GABRR3A8MPY1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRR3A8MPY1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GABRR3A8MPY1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GABRR3A8MPY1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GABRR3A8MPY1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GABRR3A8MPY1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRR3A8MPY1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GABRR3A8MPY1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GABRR3A8MPY1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GABRR3A8MPY1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABRR3A8MPY1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABRR3A8MPY1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GABRR3A8MPY1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GABRR3A8MPY1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRR3A8MPY1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRR3A8MPY1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GABRR3A8MPY1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GABRR3A8MPY1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRR3A8MPY1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GABRR3A8MPY1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRR3A8MPY1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRR3A8MPY1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GABRR3A8MPY1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GABRR3A8MPY1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GABRR3A8MPY1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms