Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM200CA6NKL6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMEM200CA6NKL6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM200CA6NKL6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMEM200CA6NKL6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM200CA6NKL6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMEM200CA6NKL6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM200CA6NKL6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TMEM200CA6NKL6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM200CA6NKL6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TMEM200CA6NKL6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM200CA6NKL6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM200CA6NKL6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM200CA6NKL6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM200CA6NKL6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM200CA6NKL6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM200CA6NKL6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM200CA6NKL6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM200CA6NKL6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM200CA6NKL6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM200CA6NKL6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM200CA6NKL6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM200CA6NKL6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM200CA6NKL6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM200CA6NKL6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM200CA6NKL6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM200CA6NKL6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM200CA6NKL6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM200CA6NKL6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM200CA6NKL6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM200CA6NKL6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM200CA6NKL6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM200CA6NKL6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM200CA6NKL6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM200CA6NKL6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM200CA6NKL6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM200CA6NKL6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM200CA6NKL6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM200CA6NKL6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM200CA6NKL6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM200CA6NKL6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM200CA6NKL6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM200CA6NKL6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM200CA6NKL6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM200CA6NKL6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM200CA6NKL6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM200CA6NKL6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM200CA6NKL6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TMEM200CA6NKL6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TMEM200CA6NKL6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM200CA6NKL6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TMEM200CA6NKL6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM200CA6NKL6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TMEM200CA6NKL6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM200CA6NKL6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM200CA6NKL6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM200CA6NKL6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TMEM200CA6NKL6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM200CA6NKL6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
TMEM200CA6NKL6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TMEM200CA6NKL6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TMEM200CA6NKL6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms