Protein–RNA interactions for Protein: A6NJ88

SAGE2P, Putative SAGE1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAGE2PA6NJ88 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAGE2PA6NJ88 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAGE2PA6NJ88 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAGE2PA6NJ88 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAGE2PA6NJ88 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SAGE2PA6NJ88 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SAGE2PA6NJ88 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SAGE2PA6NJ88 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SAGE2PA6NJ88 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SAGE2PA6NJ88 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAGE2PA6NJ88 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SAGE2PA6NJ88 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SAGE2PA6NJ88 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAGE2PA6NJ88 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAGE2PA6NJ88 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAGE2PA6NJ88 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAGE2PA6NJ88 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAGE2PA6NJ88 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SAGE2PA6NJ88 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SAGE2PA6NJ88 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAGE2PA6NJ88 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SAGE2PA6NJ88 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SAGE2PA6NJ88 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SAGE2PA6NJ88 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SAGE2PA6NJ88 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAGE2PA6NJ88 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SAGE2PA6NJ88 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAGE2PA6NJ88 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SAGE2PA6NJ88 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAGE2PA6NJ88 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAGE2PA6NJ88 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SAGE2PA6NJ88 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAGE2PA6NJ88 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAGE2PA6NJ88 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAGE2PA6NJ88 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SAGE2PA6NJ88 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SAGE2PA6NJ88 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAGE2PA6NJ88 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SAGE2PA6NJ88 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SAGE2PA6NJ88 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SAGE2PA6NJ88 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAGE2PA6NJ88 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SAGE2PA6NJ88 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SAGE2PA6NJ88 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SAGE2PA6NJ88 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SAGE2PA6NJ88 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAGE2PA6NJ88 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SAGE2PA6NJ88 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAGE2PA6NJ88 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAGE2PA6NJ88 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SAGE2PA6NJ88 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SAGE2PA6NJ88 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAGE2PA6NJ88 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAGE2PA6NJ88 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SAGE2PA6NJ88 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SAGE2PA6NJ88 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SAGE2PA6NJ88 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms