Protein–RNA interactions for Protein: A6NFQ2

TCAF2, TRPM8 channel-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCAF2A6NFQ2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TCAF2A6NFQ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCAF2A6NFQ2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCAF2A6NFQ2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCAF2A6NFQ2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TCAF2A6NFQ2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TCAF2A6NFQ2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TCAF2A6NFQ2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
TCAF2A6NFQ2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCAF2A6NFQ2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TCAF2A6NFQ2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCAF2A6NFQ2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TCAF2A6NFQ2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TCAF2A6NFQ2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCAF2A6NFQ2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TCAF2A6NFQ2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TCAF2A6NFQ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCAF2A6NFQ2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCAF2A6NFQ2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCAF2A6NFQ2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCAF2A6NFQ2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TCAF2A6NFQ2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TCAF2A6NFQ2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCAF2A6NFQ2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TCAF2A6NFQ2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCAF2A6NFQ2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TCAF2A6NFQ2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TCAF2A6NFQ2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TCAF2A6NFQ2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCAF2A6NFQ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TCAF2A6NFQ2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCAF2A6NFQ2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCAF2A6NFQ2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCAF2A6NFQ2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TCAF2A6NFQ2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TCAF2A6NFQ2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TCAF2A6NFQ2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TCAF2A6NFQ2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCAF2A6NFQ2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TCAF2A6NFQ2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCAF2A6NFQ2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TCAF2A6NFQ2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCAF2A6NFQ2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TCAF2A6NFQ2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCAF2A6NFQ2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TCAF2A6NFQ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCAF2A6NFQ2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TCAF2A6NFQ2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
TCAF2A6NFQ2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TCAF2A6NFQ2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCAF2A6NFQ2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TCAF2A6NFQ2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TCAF2A6NFQ2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TCAF2A6NFQ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TCAF2A6NFQ2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TCAF2A6NFQ2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TCAF2A6NFQ2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TCAF2A6NFQ2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCAF2A6NFQ2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
TCAF2A6NFQ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TCAF2A6NFQ2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TCAF2A6NFQ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
TCAF2A6NFQ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCAF2A6NFQ2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TCAF2A6NFQ2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms