Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE2

SMCO2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO2A6NFE2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SMCO2A6NFE2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SMCO2A6NFE2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SMCO2A6NFE2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SMCO2A6NFE2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SMCO2A6NFE2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
SMCO2A6NFE2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SMCO2A6NFE2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SMCO2A6NFE2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SMCO2A6NFE2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SMCO2A6NFE2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SMCO2A6NFE2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SMCO2A6NFE2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SMCO2A6NFE2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SMCO2A6NFE2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SMCO2A6NFE2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SMCO2A6NFE2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SMCO2A6NFE2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SMCO2A6NFE2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
SMCO2A6NFE2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
SMCO2A6NFE2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
SMCO2A6NFE2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SMCO2A6NFE2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SMCO2A6NFE2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
SMCO2A6NFE2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
SMCO2A6NFE2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SMCO2A6NFE2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
SMCO2A6NFE2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
SMCO2A6NFE2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.11■■■□□ 2.57
SMCO2A6NFE2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
SMCO2A6NFE2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SMCO2A6NFE2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SMCO2A6NFE2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
SMCO2A6NFE2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
SMCO2A6NFE2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SMCO2A6NFE2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
SMCO2A6NFE2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SMCO2A6NFE2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SMCO2A6NFE2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SMCO2A6NFE2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SMCO2A6NFE2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMCO2A6NFE2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMCO2A6NFE2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SMCO2A6NFE2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SMCO2A6NFE2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
SMCO2A6NFE2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
SMCO2A6NFE2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMCO2A6NFE2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
SMCO2A6NFE2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SMCO2A6NFE2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMCO2A6NFE2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMCO2A6NFE2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMCO2A6NFE2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMCO2A6NFE2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMCO2A6NFE2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMCO2A6NFE2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMCO2A6NFE2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMCO2A6NFE2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMCO2A6NFE2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SMCO2A6NFE2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMCO2A6NFE2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMCO2A6NFE2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
SMCO2A6NFE2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMCO2A6NFE2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMCO2A6NFE2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SMCO2A6NFE2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SMCO2A6NFE2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SMCO2A6NFE2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms