Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
LAMB4A4D0S4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
LAMB4A4D0S4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
LAMB4A4D0S4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
LAMB4A4D0S4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LAMB4A4D0S4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
LAMB4A4D0S4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LAMB4A4D0S4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
LAMB4A4D0S4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LAMB4A4D0S4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
LAMB4A4D0S4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
LAMB4A4D0S4 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
LAMB4A4D0S4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
LAMB4A4D0S4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
LAMB4A4D0S4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LAMB4A4D0S4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
LAMB4A4D0S4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LAMB4A4D0S4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
LAMB4A4D0S4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LAMB4A4D0S4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
LAMB4A4D0S4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMB4A4D0S4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMB4A4D0S4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
LAMB4A4D0S4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
LAMB4A4D0S4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LAMB4A4D0S4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
LAMB4A4D0S4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
LAMB4A4D0S4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
LAMB4A4D0S4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
LAMB4A4D0S4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
LAMB4A4D0S4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LAMB4A4D0S4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LAMB4A4D0S4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
LAMB4A4D0S4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
LAMB4A4D0S4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LAMB4A4D0S4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
LAMB4A4D0S4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
LAMB4A4D0S4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
LAMB4A4D0S4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
LAMB4A4D0S4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LAMB4A4D0S4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
LAMB4A4D0S4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LAMB4A4D0S4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
LAMB4A4D0S4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
LAMB4A4D0S4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
LAMB4A4D0S4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LAMB4A4D0S4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
LAMB4A4D0S4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
LAMB4A4D0S4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
LAMB4A4D0S4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
LAMB4A4D0S4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
LAMB4A4D0S4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.76■■■■□ 3.15
LAMB4A4D0S4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
LAMB4A4D0S4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
LAMB4A4D0S4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
LAMB4A4D0S4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
LAMB4A4D0S4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
LAMB4A4D0S4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LAMB4A4D0S4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LAMB4A4D0S4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
LAMB4A4D0S4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LAMB4A4D0S4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LAMB4A4D0S4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
LAMB4A4D0S4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
LAMB4A4D0S4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LAMB4A4D0S4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
LAMB4A4D0S4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
LAMB4A4D0S4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC34.67■■■■□ 3.14
LAMB4A4D0S4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
LAMB4A4D0S4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LAMB4A4D0S4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LAMB4A4D0S4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
LAMB4A4D0S4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LAMB4A4D0S4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LAMB4A4D0S4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LAMB4A4D0S4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LAMB4A4D0S4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LAMB4A4D0S4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
LAMB4A4D0S4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LAMB4A4D0S4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LAMB4A4D0S4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LAMB4A4D0S4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
LAMB4A4D0S4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
LAMB4A4D0S4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LAMB4A4D0S4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms