Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
PTPDC1A2A3K4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
PTPDC1A2A3K4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PTPDC1A2A3K4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
PTPDC1A2A3K4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
PTPDC1A2A3K4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
PTPDC1A2A3K4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
PTPDC1A2A3K4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
PTPDC1A2A3K4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPDC1A2A3K4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
PTPDC1A2A3K4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPDC1A2A3K4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
PTPDC1A2A3K4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPDC1A2A3K4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
PTPDC1A2A3K4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
PTPDC1A2A3K4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
PTPDC1A2A3K4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPDC1A2A3K4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPDC1A2A3K4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
PTPDC1A2A3K4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPDC1A2A3K4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
PTPDC1A2A3K4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPDC1A2A3K4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPDC1A2A3K4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
PTPDC1A2A3K4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PTPDC1A2A3K4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PTPDC1A2A3K4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
PTPDC1A2A3K4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPDC1A2A3K4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPDC1A2A3K4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPDC1A2A3K4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
PTPDC1A2A3K4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
PTPDC1A2A3K4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
PTPDC1A2A3K4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPDC1A2A3K4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPDC1A2A3K4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
PTPDC1A2A3K4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
PTPDC1A2A3K4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPDC1A2A3K4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPDC1A2A3K4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPDC1A2A3K4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
PTPDC1A2A3K4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
PTPDC1A2A3K4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
PTPDC1A2A3K4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC31.82■■■□□ 2.68
PTPDC1A2A3K4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPDC1A2A3K4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
PTPDC1A2A3K4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
PTPDC1A2A3K4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPDC1A2A3K4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPDC1A2A3K4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PTPDC1A2A3K4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPDC1A2A3K4 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPDC1A2A3K4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPDC1A2A3K4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PTPDC1A2A3K4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PTPDC1A2A3K4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PTPDC1A2A3K4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPDC1A2A3K4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
PTPDC1A2A3K4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PTPDC1A2A3K4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
PTPDC1A2A3K4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPDC1A2A3K4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPDC1A2A3K4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PTPDC1A2A3K4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPDC1A2A3K4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PTPDC1A2A3K4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PTPDC1A2A3K4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PTPDC1A2A3K4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
PTPDC1A2A3K4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
PTPDC1A2A3K4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
PTPDC1A2A3K4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPDC1A2A3K4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PTPDC1A2A3K4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
PTPDC1A2A3K4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PTPDC1A2A3K4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
PTPDC1A2A3K4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPDC1A2A3K4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PTPDC1A2A3K4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
PTPDC1A2A3K4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PTPDC1A2A3K4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PTPDC1A2A3K4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms