Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTC26A0AVF1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTC26A0AVF1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTC26A0AVF1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TTC26A0AVF1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TTC26A0AVF1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TTC26A0AVF1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTC26A0AVF1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC26A0AVF1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC26A0AVF1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TTC26A0AVF1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC26A0AVF1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC26A0AVF1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC26A0AVF1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC26A0AVF1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
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