Protein–RNA interactions for Protein: A0AVF1

TTC26, Intraflagellar transport protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC26A0AVF1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTC26A0AVF1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTC26A0AVF1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTC26A0AVF1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTC26A0AVF1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TTC26A0AVF1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TTC26A0AVF1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TTC26A0AVF1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TTC26A0AVF1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
TTC26A0AVF1 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TTC26A0AVF1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TTC26A0AVF1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TTC26A0AVF1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TTC26A0AVF1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC26A0AVF1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TTC26A0AVF1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TTC26A0AVF1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TTC26A0AVF1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC26A0AVF1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TTC26A0AVF1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TTC26A0AVF1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TTC26A0AVF1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
TTC26A0AVF1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.5 ms