Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYG2

TRBV6-6, T-cell receptor beta variable 6-6 (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRBV6-6A0A0A6YYG2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
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