Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6H8

IGKV1D-42, Immunoglobulin kappa variable 1D-42 (non-functional) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1D-42A0A075B6H8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGKV1D-42A0A075B6H8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
IGKV1D-42A0A075B6H8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGKV1D-42A0A075B6H8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGKV1D-42A0A075B6H8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGKV1D-42A0A075B6H8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGKV1D-42A0A075B6H8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGKV1D-42A0A075B6H8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGKV1D-42A0A075B6H8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGKV1D-42A0A075B6H8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGKV1D-42A0A075B6H8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IGKV1D-42A0A075B6H8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGKV1D-42A0A075B6H8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV1D-42A0A075B6H8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV1D-42A0A075B6H8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV1D-42A0A075B6H8 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGKV1D-42A0A075B6H8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGKV1D-42A0A075B6H8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IGKV1D-42A0A075B6H8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGKV1D-42A0A075B6H8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGKV1D-42A0A075B6H8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGKV1D-42A0A075B6H8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGKV1D-42A0A075B6H8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGKV1D-42A0A075B6H8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
IGKV1D-42A0A075B6H8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IGKV1D-42A0A075B6H8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGKV1D-42A0A075B6H8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGKV1D-42A0A075B6H8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IGKV1D-42A0A075B6H8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IGKV1D-42A0A075B6H8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGKV1D-42A0A075B6H8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGKV1D-42A0A075B6H8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGKV1D-42A0A075B6H8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGKV1D-42A0A075B6H8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IGKV1D-42A0A075B6H8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGKV1D-42A0A075B6H8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGKV1D-42A0A075B6H8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGKV1D-42A0A075B6H8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGKV1D-42A0A075B6H8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV1D-42A0A075B6H8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV1D-42A0A075B6H8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV1D-42A0A075B6H8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IGKV1D-42A0A075B6H8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
IGKV1D-42A0A075B6H8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGKV1D-42A0A075B6H8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IGKV1D-42A0A075B6H8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGKV1D-42A0A075B6H8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGKV1D-42A0A075B6H8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGKV1D-42A0A075B6H8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGKV1D-42A0A075B6H8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGKV1D-42A0A075B6H8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGKV1D-42A0A075B6H8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGKV1D-42A0A075B6H8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGKV1D-42A0A075B6H8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGKV1D-42A0A075B6H8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGKV1D-42A0A075B6H8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGKV1D-42A0A075B6H8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGKV1D-42A0A075B6H8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGKV1D-42A0A075B6H8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
IGKV1D-42A0A075B6H8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV1D-42A0A075B6H8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
IGKV1D-42A0A075B6H8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IGKV1D-42A0A075B6H8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
IGKV1D-42A0A075B6H8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGKV1D-42A0A075B6H8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms