Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFW9

MYRIP, Rab effector MyRIP, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYRIPQ8NFW9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYRIPQ8NFW9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYRIPQ8NFW9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms