Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 METTL26-206ENST00000448973 1710 ntTSL 1 (best)25.9■■□□□ 1.744e-9■■■■□ 26.5
PCBP1Q15365 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.344e-9■■■■□ 26.5
PCBP1Q15365 METTL26-211ENST00000568077 588 ntTSL 320.72■□□□□ 0.914e-9■■■■□ 26.5
PCBP1Q15365 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.644e-9■■■■□ 26.5
PCBP1Q15365 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.644e-9■■■■□ 26.5
PCBP1Q15365 METTL26-207ENST00000456420 755 ntTSL 319.02■□□□□ 0.644e-9■■■■□ 26.5
PCBP1Q15365 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.524e-9■■■■□ 26.5
PCBP1Q15365 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.44e-9■■■■□ 26.5
PCBP1Q15365 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.324e-9■■■■□ 26.5
PCBP1Q15365 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.172e-6■■■■□ 26.4
PCBP1Q15365 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.734e-7■■■■□ 26.4
PCBP1Q15365 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.993e-7■■■■□ 26.3
PCBP1Q15365 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.145e-8■■■■□ 26.3
PCBP1Q15365 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.265e-8■■■■□ 26.3
PCBP1Q15365 GNB2-208ENST00000431068 910 ntTSL 519.27■□□□□ 0.688e-11■■■■□ 26.3
PCBP1Q15365 GNB2-204ENST00000412215 545 ntTSL 416.78■□□□□ 0.288e-11■■■■□ 26.3
PCBP1Q15365 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.094e-7■■■■□ 26.3
PCBP1Q15365 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.234e-7■■■■□ 26.3
PCBP1Q15365 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.254e-7■■■■□ 26.3
PCBP1Q15365 FAM122B-208ENST00000611027 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.574e-7■■■■□ 26.3
PCBP1Q15365 FAM122B-207ENST00000493333 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.734e-7■■■■□ 26.3
PCBP1Q15365 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.674e-6■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 PNPLA2-202ENST00000525250 2726 ntTSL 219.21■□□□□ 0.674e-6■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.271e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.161e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.111e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 SPPL2B-204ENST00000587851 586 ntTSL 323.86■■□□□ 1.411e-6■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 318.49■□□□□ 0.551e-6■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 SPPL2B-203ENST00000586332 496 ntTSL 317.95■□□□□ 0.461e-6■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 MAP7D1-202ENST00000373148 1797 ntTSL 229.97■■■□□ 2.395e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 ROCK2-201ENST00000261535 1795 ntTSL 523.91■■□□□ 1.425e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 MAP7D1-212ENST00000530975 744 ntTSL 522.81■■□□□ 1.245e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 MAP7D1-209ENST00000487131 733 ntTSL 520.7■□□□□ 0.95e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.755e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.675e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.425e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.255e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.065e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -05e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 PNP-201ENST00000361505 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.245e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 PNP-204ENST00000554056 1635 ntTSL 512.26□□□□□ -0.455e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 PNP-207ENST00000556754 2573 ntTSL 29.6□□□□□ -0.875e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 PTBP3-205ENST00000374257 7240 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.995e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 PTBP3-203ENST00000343327 2755 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.075e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 PTBP3-204ENST00000374255 3413 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.01□□□□□ -1.135e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 ROCK2-206ENST00000462366 563 ntTSL 37.69□□□□□ -1.185e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.425e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.55e-8■■■■□ 26.2
PCBP1Q15365 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.514e-7■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.32e-28■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 GABARAP-202ENST00000570856 583 ntTSL 214.85□□□□□ -0.032e-28■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 GABARAP-203ENST00000571129 568 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.32e-28■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 GABARAP-206ENST00000577035 762 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-28■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.614e-7■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 PPDPF-204ENST00000473620 478 ntTSL 221.18■□□□□ 0.981e-23■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.331e-23■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-23■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.611e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 PRDM2-209ENST00000491134 1100 ntTSL 320.07■□□□□ 0.83e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 SSR2-207ENST00000473699 1027 ntTSL 317.19■□□□□ 0.341e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 SSR2-211ENST00000484320 1148 ntTSL 516.07■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.083e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 SSR2-209ENST00000480176 1040 ntTSL 214.57□□□□□ -0.081e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 PRDM2-214ENST00000505823 568 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.273e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 PRDM2-204ENST00000376048 2688 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.523e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 SSR2-218ENST00000532074 1008 ntTSL 511.59□□□□□ -0.551e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 SSR2-213ENST00000496742 825 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.751e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 SSR2-201ENST00000295702 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.821e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 SSR2-205ENST00000472467 1833 ntTSL 29.69□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 SSR2-212ENST00000488179 1712 ntTSL 59.22□□□□□ -0.931e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 SSR2-215ENST00000529008 849 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.971e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.033e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 PRDM2-201ENST00000235372 7957 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.223e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.313e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.453e-6■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 FCGRT-215ENST00000598936 870 ntTSL 318.13■□□□□ 0.491e-7■■■■□ 26.1
PCBP1Q15365 ANXA7-205ENST00000492380 843 ntTSL 517.75■□□□□ 0.436e-7■■■■□ 26
PCBP1Q15365 ANXA7-201ENST00000372919 2174 ntTSL 1 (best)13.59□□□□□ -0.236e-7■■■■□ 26
PCBP1Q15365 ANXA7-203ENST00000394847 648 ntTSL 511.87□□□□□ -0.516e-7■■■■□ 26
PCBP1Q15365 ANXA7-202ENST00000372921 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.756e-7■■■■□ 26
PCBP1Q15365 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.456e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.956e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 AL121845.3-203ENST00000496820 507 ntTSL 525.76■■□□□ 1.716e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 ATP6V0B-208ENST00000473485 1664 ntTSL 224.04■■□□□ 1.448e-8■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 LIME1-204ENST00000476183 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 523.47■■□□□ 1.356e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.358e-8■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 AL121845.3-202ENST00000632538 872 ntAPPRIS P1 TSL 323.41■■□□□ 1.346e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 ATP6V0B-203ENST00000468183 2432 ntTSL 1 (best)22.23■■□□□ 1.158e-8■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.096e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.068e-8■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 TUFM-204ENST00000569217 814 ntTSL 219.67■□□□□ 0.744e-8■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.656e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.594e-8■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.496e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.38e-8■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.38e-8■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.292e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.216e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 VCP-207ENST00000493886 2942 ntTSL 214.44□□□□□ -0.16e-7■■■■□ 25.9
PCBP1Q15365 RNF187-202ENST00000482739 2467 ntTSL 514.33□□□□□ -0.122e-7■■■■□ 25.9
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