Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 TGFB1-203ENST00000598758 559 ntTSL 511.61□□□□□ -0.552e-10■■■■■ 28.8
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PABPC4Q13310 RNH1-210ENST00000525701 1794 ntTSL 524■■□□□ 1.435e-7■■■■■ 28.8
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PABPC4Q13310 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.245e-7■■■■■ 28.8
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PABPC4Q13310 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.825e-7■■■■■ 28.8
PABPC4Q13310 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.735e-7■■■■■ 28.8
PABPC4Q13310 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.045e-7■■■■■ 28.8
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PABPC4Q13310 WWP2-202ENST00000359154 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.193e-6■■■■■ 28.8
PABPC4Q13310 WWP2-201ENST00000356003 4227 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 28.8
PABPC4Q13310 WWP2-213ENST00000568684 3672 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.543e-6■■■■■ 28.8
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PABPC4Q13310 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.937e-20■■■■■ 28.8
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PABPC4Q13310 PLOD3-201ENST00000223127 2920 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 28.8
PABPC4Q13310 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.058e-11■■■■■ 28.8
PABPC4Q13310 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.191e-6■■■■■ 28.8
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PABPC4Q13310 RAB24-205ENST00000471466 1642 ntTSL 522.43■■□□□ 1.183e-6■■■■■ 28.7
PABPC4Q13310 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.013e-6■■■■■ 28.7
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PABPC4Q13310 IP6K1-201ENST00000321599 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.015e-6■■■■■ 28.7
PABPC4Q13310 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.175e-6■■■■■ 28.7
PABPC4Q13310 IP6K1-209ENST00000613416 4806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.55e-6■■■■■ 28.7
PABPC4Q13310 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.315e-7■■■■■ 28.7
PABPC4Q13310 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.255e-7■■■■■ 28.7
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PABPC4Q13310 XRCC3-202ENST00000553264 3018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 28.7
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PABPC4Q13310 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.465e-10■■■■■ 28.7
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PABPC4Q13310 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 28.6
PABPC4Q13310 CHID1-220ENST00000532909 619 ntTSL 523.07■■□□□ 1.282e-7■■■■■ 28.6
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PABPC4Q13310 RPS24-205ENST00000464716 452 ntTSL 25.26□□□□□ -1.571e-323■■■■■ 28.5
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PABPC4Q13310 MRPL55-234ENST00000497758 470 ntTSL 314□□□□□ -0.179e-7■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 FBXL19-203ENST00000427128 3312 ntTSL 1 (best)17.69■□□□□ 0.427e-7■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.377e-7■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.287e-7■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.067e-7■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.23e-7■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 MRPL54-202ENST00000589174 491 ntTSL 313.46□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 31e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CARD9-203ENST00000460290 1061 ntTSL 330.19■■■□□ 2.421e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.271e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.061e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.018e-18■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC27.02■■□□□ 1.921e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.91e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.891e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.891e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.831e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.721e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 SIRT3-214ENST00000532837 1588 ntTSL 225.39■■□□□ 1.651e-6■■■■■ 28.5
PABPC4Q13310 DUS3L-209ENST00000590343 833 ntTSL 225.37■■□□□ 1.651e-6■■■■■ 28.5
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