Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FAM3BP58499 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
FAM3BP58499 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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