Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFKB1P19838 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NFKB1P19838 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms