Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NOTOA8MTQ0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NOTOA8MTQ0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms